MSD fait depuis longtemps le choix de privilégier les alliances stratégiques avec d'autres sociétés pour compléter ses capacités de recherche et d’innovation.
Des collaborations ont ainsi été initiées avec des centaines d'entreprises, d'instituts et d'universités à travers le monde. Cette mise en commun de moyens est un atout pour découvrir de nouvelles molécules et développer de nouvelles formes de traitements.

Grâce à ces alliances stratégiques avec d'autres grandes entreprises, de nombreux médicaments actuellement en développement pourront voir le jour. C'est le cas de l'ézétimibe développé dans le cadre d'un partenariat mondial avec Schering-Plough.

Parmi les récentes collaborations et alliances avec des sociétés notamment de biotechnologies :

Acumen (Etats-Unis) : rechercher et développer des médicaments agissant comme traitement de fond de la maladie d’Alzheimer et d’autres troubles de la mémoire.

Alnylam (Etats-Unis) : développement des technologies et des traitements fondés sur l’ARN interférent (ARNi) dans les pathologies oculaires.

Amrad (Australie) : développement de molécules dans les domaines de l’asthme, d’autres maladies respiratoires et de l’oncologie.

Aton pharma, Inc. (Etats-Unis) : identification et développement de molécules dans le cancer.

Dov Pharmaceutical (Etats-Unis) : développement de nouvelles molécules dans la dépression.

Epimmune (Etats-Unis) : développement de produits pharmaceutiques (vaccin) utilisant des déterminants antigéniques pour activer le système immunitaire.

Kyorin Pharmaceutical (Japon) : recherche et développement dans les maladies infectieuses.

Lundbeck (Danemark) : développement d'une molécule dans le traitement des troubles du sommeil.

MerLion Pharma (Singapour) : criblage à partir de sources naturelles.

Metabasis Therapeutics (Etats-Unis) : collaboration pour développer de nouveaux traitements contre l’hépatite C : développement de nouvelles molécules dans le traitement des infections par le virus de l’hépatite C, à partir de la technologie de ciblage du foie HepDirect.

Nastech Pharmaceuticals (Etats-Unis) : développement d'un peptide sous forme de spray nasal dans le traitement de l'obésité.

NicOx (France) : recherche de molécules donneuses d’oxyde nitrique.

Ono Pharmaceutical (Japon) : licence mondiale pour la forme injectable d'une nouvelle molécule en développement clinique dans le traitement de l'AVC.

Pierre Fabre médicament (France) : recherche et développement d'un anticorps humain recombinant dans le traitement du cancer.

Sunesis Pharmaceuticals (Etats-Unis) : développement de nouveaux traitements dans la maladie d’Alzheimer à partir d’une technologie de ciblage.

Transgène (France) : développement de vaccins à partir des technologies de vecteurs viraux recombinants utilisés pour différents types de produits biologiques.

Trans Tech Pharma (Etats-Unis) : recherche dans l'utilisation de la technologie Trans Tech.

Vertex (Etats-Unis) : développement d'un composé dans le cancer.